99 - العمد في الإمامة ، ذكر السيد ابن طاووس في الطرائف عند نقله عنه أن اسمه " العمدة " . 100 - العويص في الأحكام ، ابتدأ فيه بمسائل في النكاح ثم بمسائل في الطلاق والميراث والاقرار ، توجد نسخ منه ويظهر من بعضها أنه مختصر من العويص . 101 - العيون والمحاسن ، توجد نسخة منه في المكتبة الرضوية وغيرها 102 - الفرائض الشرعية في مسألة المواريث 103 - الفصول من العيون والمحاسن ، والذي يظهر من ذكر النجاشي له مع العيون والمحاسن أنهما متعددان وهو غير الفصول للسيد المرتضى الموجود الآن . 104 - الفضائل ، ذكره السروي في المعالم 105 - قضية العقل على الأفعال وسماه السروي " فيضة العقل على الأفعال " 106 - الكامل في الدين ، أحال إليه نفسه في مسألة الفرق بين الشيعة والمعتزلة والفصل بين العدلية منهما والقول في اللطيف من الكلام وفي أواخر الفصول المختارة للمرتضى . 107 - كتاب في إمامة أمير المؤمنين عليه السلام من القرآن . 108 - كتاب في قوله صلى الله عليه وسلم " أنت مني بمنزلة هارون من موسى " . 109 - كتاب في قوله تعالى " فاسئلوا أهل الذكر " . 110 - كتاب في الخبر المختلق بغير أثر 111 - كتاب القول في دلائل القرآن 112 - كتاب في الغيبة 113 - كتاب في القياس 114 - كتاب في المتعة 115 - كشف الالتباس